1、科属区别。穿山甲：为动物界、脊索动物门、脊椎动物亚门、哺乳纲、真兽亚纲、鳞甲目、穿山甲科、穿山甲属地栖性哺乳动物；食蚁兽：食蚁兽为动物界、脊索动物门、脊椎动物亚门、哺乳纲、披毛目、食蚁兽科哺乳动物。
2、形态区别。穿山甲：体形狭长，全身有鳞甲，四肢粗短，尾扁平而长，背面略隆起，头呈圆锥状，眼小，吻尖，舌长，无齿，耳不发达，足具5趾，并有强爪，前足爪长，全身鳞甲如瓦状，自额顶部至背、四肢外侧、尾背腹面都有，鳞甲从背脊中央向两侧排列，呈纵列状，鳞片呈黑褐色，绒毛极少；食蚁兽：食蚁兽吻部尖长，嘴管形，舌可伸缩，并富有粘液，适于舐食昆虫，耳小而圆，前肢力强，第三指具特别发达并呈镰刀状的钩爪，后肢4-5趾亦具爪。头骨细长而脆弱，无齿。
3、分布区别。穿山甲：生活在山麓地带的草丛中或较潮湿的丘陵杂灌丛，挖洞居住，多筑洞于泥土地带，主要分布于东南亚及非洲的部分国家；食蚁兽：侏食蚁兽树栖，大食蚁兽主要栖于潮湿的森林和沼泽地带，小食蚁兽日间多隐蔽在密林或躲在树洞里，夜间出来觅食，常用前肢爪捣毁蚁巢，主要分布于中美洲和南美洲从墨西哥最南端到巴西、巴拉圭的广大地区。
4、食性区别。穿山甲：其主要食物为白蚁，此外也食蚁及其幼虫、蜜蜂、胡蜂和其它昆虫幼虫等，食量很大，一只成年穿山甲的胃，最多可以容纳500克白蚁；食蚁兽：食蚁兽吃蚂蚁、白蚁及其他昆虫，舌头能惊人地伸到60厘米长，并能以一分钟150次的频率伸缩，舌头上遍布小刺并有大量的粘液，蚂蚁被粘住后将无法逃脱，食量很大，一次可食454克重的蚂蚁。
